换专业申请H1B

情况有点复杂，本人第一个硕士是艺术类，没拿到工签，又学了第二个专业MS／information system engineering and management，并用这个专业的CPT在现在这家公司工作，职位是多媒体设计师，视频剪辑、特效、及html5, javacript等网页内容。由于没毕业，今年申H1B打算用第一个艺术类硕士学位。从工作性质上讲，第一个艺术类学位更相符，但一直以来用的是第二个学位的CPT。。。。

这样申请H1B会有什么问题，我应该如何准备？